İnsan doğasına ilişkin fikirlerden etkilenen roman, uygarlıktan uzak tropik bir adada doğup yaşayan Paul ve Virginie adlı genç bir erkek ve genç kızın hikayesini anlatıyor. Romanın kahramanları, Hint Okyanusu'nun güneybatısında, bugün Mauritius olarak bilinen Île de France adasında şehir yaşamının, toplumların ve teknolojinin yozlaştırıcı etkisinden uzak olarak, doğayla bir bütünlük halinde yaşarlar. Beraberler büyürler, arkadaş olurlar, yavaş yavaş birbirlerine aşık olurlar; ancak ilkel saflıklarından dolayı duygularını hemen açıklayamaz ve açığa vuramazlar. Paul ve Virginie’nin ilişkileri ve adeta cennete benzer yaşamları medeniyetin araya girmesiyle sarsılır.